蛋白语言模型挖掘环境β-内酰胺酶多样性
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蛋白语言模型挖掘环境β-内酰胺酶多样性
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AI 综述
Liangjun Ge等作者发表研究,将蛋白质语言模型与集成学习结合,从环境宏基因组中鉴定出超过 46,000 个潜在β-内酰胺酶,覆盖全部四个 Ambler 类,广泛分布于多种栖息地,且不同栖息地的类别组成存在差异。 研究称,与已知β-内酰胺酶序列一致性约 30% 的候选酶在大肠杆菌中表达后,可赋予对多种β-内酰胺类抗生素的抗性。作者还结合反向折叠模型与蛋白质语言模型,识别出能改变抗性谱的突变,包括增强碳青霉烯类抗性的替换。上述抗性效果来自研究者的实验与模型分析,尚未经独立验证。
AI 根据报道生成 · 10 小时前更新
最新进展11月14日 13:00
深度学习引导的发现揭示环境β-内酰胺酶的多样性与突变潜力报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月14日
- arXiv cs.AI深度学习引导的发现揭示环境β-内酰胺酶的多样性与突变潜力
研究结合蛋白质语言模型(PLMs)与集成学习,从环境宏基因组中鉴定出超过 46,000 个覆盖全部四个 Ambler 类的潜在β-内酰胺酶,广泛分布于多种栖息地。与已知β-内酰胺酶序列一致性约 30% 的候选酶在大肠杆菌中表达后可赋予多种β-内酰胺类抗生素抗性。结合反向折叠模型与 PLMs 进一步识别出改变抗性谱的突变,包括增强碳青霉烯类抗性的替换。
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