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arXiv cs.MA· Tianmeng Hu, Biao Luo, Ke Li·· 3 天前AI 评分23

TANGO:RNA 拓扑与几何协同设计

TANGO: RNA Topology and Geometry Co-Design

AI 导读

TANGO 将 RNA 逆设计建模为拓扑与几何协同设计问题,提出多目标多智能体强化学习框架,先学习二级结构拓扑感知策略,再迁移至三级结构训练通用协同设计模型,最后用前沿引导微调优化权衡。实验显示,其三级和二级结构性能分别比最强基线提升 18.3% 和 52.7%,并能生成多样且新颖的设计。

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摘要:设计满足目标三级结构约束的 RNA 序列是 RNA 工程中的一个重要问题,在合成生物学和治疗领域有广泛应用。现有的 3D RNA 设计方法已取得实质性进展,但它们大多将目标折叠视为仅基于几何的目标。这对 RNA 来说是不完整的,因为 RNA 的功能折叠不仅由三级几何结构决定,还由二级碱基配对拓扑决定。因此,我们将 RNA 逆向设计表述为拓扑与几何协同设计问题,并提出 TANGO,一个用于该任务的多目标多智能体强化学习框架。TANGO 采用分阶段课程:首先从二级结构目标学习拓扑感知策略,然后将该策略迁移到三级结构目标以训练通用协同设计模型,最后应用前沿引导微调来优化二级结构保真度、三级结构保真度和序列多样性之间的目标特定权衡。实验表明,TANGO 生成了多样且新颖的设计,在三级和二级结构性能上分别比最强基线提升了 18.3% 和 52.7%。
评论: NeurIPS 2026
主题: 机器学习(cs.LG);多智能体系统(cs.MA)
MSC 分类: I.2.6
引用为: arXiv:2610.20277 [cs.LG]
  (或 arXiv:2610.20277v1 [cs.LG] 用于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2610.20277

arXiv 颁发的 DOI 通过 DataCite(待注册)

提交历史

来自:Tianmeng Hu [查看电子邮件]
[v1] 2026年10月14日星期三 14:37:51 UTC(3,783 KB)

来源:arXiv cs.MA · arxiv.org