Ars Technica · AI· John Timmer·· 4 天前AI 评分57
研究人员用 AI 设计可切割其他蛋白的蛋白酶
Researchers use AI to design proteins that cut up other proteins
AI 导读
研究人员用基于 AI 的蛋白设计工具,取两类蛋白酶的催化核心并替换其余全部结构,设计出可定向切割特定蛋白的酶。他们通过切割与神经疾病相关的蛋白验证了这些酶的有效性,相当于跳过了蛋白酶自然多样化的演化过程。原文指出肽键本身极为稳定,估计半衰期达数百年,而生物体演化出多种催化肽键断裂的方式。
正文 · AI 翻译
蛋白质是由氨基酸通过所谓的肽键连接而成的链。单独的肽键极其稳定,估计其半衰期长达数百年。但在地球环境中,大多数蛋白质的寿命远没有这么长。这是因为生物体进化出了几种催化肽键断裂的方式,这些方式已分化成无数专门的蛋白质消化酶。蛋白酶无处不在,通常能迅速分解任何进入环境的蛋白质。
如今,研究人员基本上绕过了这一分化过程,利用基于人工智能的蛋白质设计工具,取两种蛋白酶的催化核心,并替换掉蛋白质其余的全部部分。由此产生的酶可以被调控,以将特定蛋白质切成两半,研究人员通过用它们切割与神经疾病相关的蛋白质,证明了其有效性。
切割蛋白质
基本的肽键看起来并不特别有趣——它是将氨基与酸连接时得到的产物,过程中会释放一个水分子。顾名思义,氨基酸同时具有氨基和酸基团,使它们能够在氨基酸的两侧形成肽键。这对于构建蛋白质中的长链至关重要。(氨基酸还具有具有独特化学性质的侧链,这赋予了主链特定的特性。)
来源:Ars Technica · AI · arstechnica.com