arXiv cs.AI· Wanli Ma, Tianmeng Hu, Ke Li·· 12 小时前AI 评分20
REFLEX：基于柔性校准随机桥的 RNA 构象集合生成模型
REFLEX: RNA Ensemble Generation via Flexibility-Calibrated Stochastic Bridge
AI 导读
REFLEX 是一个基于 SE(3) 上异方差随机桥的序列条件 RNA 骨架构象集合生成器，训练时用实验 B-factor 校准残基级桥宽，推理时仅需输入序列、无需 MSA 子采样启发式。在多构象 RNA 基准上，REFLEX 在各评估阈值下取得最优的集合覆盖精度-召回权衡，恢复压力消融显示更强扰动下目标构象帧恢复能力提升。
正文 · AI 翻译
摘要：RNA 分子通常通过多个实验观测到的构象状态发挥功能。一个核心挑战是在不牺牲结构保真度的前提下捕捉系综多样性：样本可能坍缩到平均化的代表性结构，或漂移到缺乏支持的构象区域。我们提出 REFLEX（由 FLEXibility 校准的 RNA 系综生成），这是一种基于 SE(3) 上异方差随机桥的序列条件 RNA 骨架坐标系系综生成器。在训练过程中，实验 B 因子校准逐残基的桥宽度，通过具有残基特异性尺度的局部扰动邻域暴露每个观测构象，同时使受约束区域保持更锐利。学习到的柔性条件引导桥场网络从这些校准后的噪声状态中恢复目标构象特异性坐标系。在推理时，REFLEX 仅使用输入序列，无需 MSA 子采样启发式方法。在多构象 RNA 基准上，REFLEX 在所有评估阈值下实现了系综覆盖的最佳精确率-召回率权衡，而恢复压力消融表明在更强扰动下目标坐标系恢复有所提升。
| 评论： | 20 页，9 幅图，6 张表 |
| 主题： | 人工智能（cs.AI） |
| 引用为： | arXiv:2610.26261 [cs.AI] |
| （或 arXiv:2610.26261v3 [cs.AI] 用于此版本） | |
| https://doi.org/10.48550/arXiv.2610.26261 由 DataCite 颁发的 arXiv DOI |
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2026 年 10 月 19 日星期一 12:18:09 UTC（6,542 KB）
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来源：arXiv cs.AI · arxiv.org