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arXiv cs.AI· Ziyang Song, Lia Shen, Yixuan Li, Qincheng Lu, Weihao Li, Haoran Xu, He Zhu, Xinyu Wang, Yue Li·· 3 天前AI 评分22

SMI:基于本体论语义 ID 的层级感知医学概念表示

SMI: Ontology-Grounded Semantic IDs for Hierarchy-Aware Medical Concept Representation

AI 导读

研究者提出免训练的 Semantic Medical Identifier(SMI)框架,将每个诊断、手术或药物概念的 Semantic ID 定义为医学本体中由粗到细的路径,并聚合冻结的生物医学 LM 嵌入生成层级感知的医学概念表示。

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摘要:生物医学语言模型(LM)为临床任务提供了强大的表征,但它们往往无法捕捉医学概念之间的层次结构。这一局限在长尾词表中罕见且细粒度的临床编码上尤为突出,因为随着概念频率降低,与层次无关的 LM 表征所携带的信息越来越少。我们提出语义医学标识符(Semantic Medical Identifier,SMI),一个无需训练的框架,用于构建基于本体的语义 ID 和具有层次感知的医学概念表征。对于每个诊断、操作或药物概念,SMI 将其语义 ID 定义为通过专家定义的医学本体从粗到细的路径。SMI 随后聚合相应本体层级上的冻结生物医学 LM 嵌入,形成保留从粗到细临床语义的层次感知医学概念表征。基础 SMI 在本体各层级上使用均匀聚合,而层级加权变体在验证数据上选择全局层级权重。我们的理论分析表明,SMI 产生的医学概念表征比与层次无关的 LM 嵌入更具信息量,尤其是对于罕见且细粒度的临床概念。实验表明,SMI 捕捉到了有意义的层次结构,并改进了临床关系预测。在 MIMIC-IV 上,SMI 改进了死亡率预测、再入院预测、药物推荐和罕见药物预测。在 eICU 上,SMI 在跨医院分布偏移下产生了更稳健的患者表征。
评论: 已被 NeurIPS 2026(主赛道)接收
主题: 计算与语言(cs.CL);人工智能(cs.AI)
引用为: arXiv:2610.18672 [cs.CL]
  (或 arXiv:2610.18672v1 [cs.CL] 用于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2610.18672

arXiv 颁发的 DOI 通过 DataCite(待注册)

提交历史

来自:Ziyang Song [查看电子邮件]
[v1] 2026年10月13日星期二 16:30:01 UTC(3,333 KB)

来源:arXiv cs.AI · arxiv.org