arXiv cs.CL· Yaoyao Xu, Xinjian Zhao, Xiaozhuang Song, Lei Bai, Tianshu Yu·· 2 天前AI 评分22
LoopMol：用语义 LLM 代理实现闭环分子逆向设计
Closed-Loop Molecular Inverse Design with Semantic LLM Surrogates
AI 导读
LoopMol 是一个闭环分子逆向设计框架，用 LLM 代理直接基于任务指令、SMILES 优化历史和 oracle 反馈进行推理，每轮按探索-利用原则挑选参考分子并可附一句简短引导语。
正文 · AI 翻译
摘要：实际的分子逆向设计很少是一次性生成问题；它通常涉及在有限的 oracle 预算下，丰富一个符合所需性质特征的分子池。贝叶斯优化（BO）为这一场景提供了自然的框架，其标准高斯过程（GP）代理模型在连续嵌入空间中运行。我们提出 LoopMol，一个闭环框架，其大语言模型（LLM）代理直接对任务指令、SMILES 级优化历史和 oracle 反馈进行推理。在每次迭代中，该代理依据探索—利用原则选择信息量大的参考分子，并可选择附带一句简洁的指导语句。这些输出为下一轮生成提供条件，并产生可检查的优化轨迹。在三个 Llamole 主干模型上针对六项药物和材料任务的实验表明，基于 LLM 的变体相比一次性生成有所改进，并且与基于 GP 的 BO 相比具有竞争力或更强。实验还揭示了一种依赖领域的接口：仅参考条件在二元药物任务上表现更好，而添加一句简洁的指导语句通常有利于连续材料任务。
| 评论： | 24 页 |
| 主题： | 计算与语言（cs.CL） |
| 引用为： | arXiv:2608.22967 [cs.CL] |
| （或 arXiv:2608.22967v3 [cs.CL] 用于此版本） | |
| https://doi.org/10.48550/arXiv.2608.22967 arXiv 颁发的 DOI 经由 DataCite |
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2026 年 8 月 24 日星期一 08:30:01 UTC（1,112 KB）
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2026 年 10 月 15 日星期四 11:09:21 UTC（1,158 KB）
来源：arXiv cs.CL · arxiv.org