MUSS:单细胞基因调控的多尺度序列模型
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MUSS:单细胞基因调控的多尺度序列模型
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AI 综述
Kangjie Zheng 等作者发布论文,提出 MUSS——一个基于序列的多尺度模型,用于建模单细胞基因调控,并称其能同时保留 DNA 层面与细胞层面的分辨率。 据论文描述,MUSS 用冻结的预训练序列编码器生成 peak 与基因表示,通过 peak-peak 自注意力与带距离偏置的 peak-gene 交互进行整合,再以 peak 掩码语言建模和配对 scATAC-seq/scRNA-seq 数据训练,对齐细胞特异的调控状态。上述能力与效果均为作者在论文中的表述。
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最新进展11月6日 13:00
MUSS:面向单细胞基因调控的多尺度序列模型报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月6日
- arXiv cs.AIMUSS:面向单细胞基因调控的多尺度序列模型
MUSS 是一个基于序列的多尺度模型,可从 DNA 中同时保留 DNA 层面与细胞层面分辨率,用于建模单细胞基因调控。它用冻结的预训练序列编码器生成 peak 与基因表示,并通过 peak-peak 自注意力与距离偏置的 peak-gene 交互整合,再经 peak 掩码语言建模和配对 scATAC-seq/scRNA-seq 训练对齐细胞特异调控状态。
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